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Los microscopios desempeñan un papel crucial en la investigación médica, el diagnóstico y el tratamiento. Permiten a los médicos y patólogos examinar con detalle muestras de tejidos y células, y detectar anomalías o signos de enfermedad.

Con el avance de la tecnología, la microscopía se ha digitalizado. Los microscopios digitales permiten capturar imágenes y vídeos de las muestras observadas y visualizarlos en una pantalla, lo que facilita el intercambio de información y la colaboración entre médicos e investigadores de todo el mundo.

Ámbitos principales donde se utiliza la microscopía óptica en medicina: dermatología, veterinaria, naturopatía, ginecología, urología, medicina interna.